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全球首个青稞基因组图谱发布

发布时间:2021-12-17 19:57
本文摘要:13日,全世界第一个青稞基因组图普月绘图成功,其研究成效线上公布发布在PNAS杂志期刊上。该研究对青稞的西藏地方品种LasaGoumang进行了全基因组转录组测序及图普绘图,获得了尺寸为3.89Gb的基因图谱,总共包含3615一个蛋白质编号遗传基因。 据报,它是阔别小麦基因组(A,D)、麦籽基因组物理学图、国际性小麦大家族基因组研究工作中的又一个划时代的转型,给未来麦类农作物的改善及其别的高原地区农作物的研究工作中获得了珍贵的参考文献。

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13日,全世界第一个青稞基因组图普月绘图成功,其研究成效线上公布发布在PNAS杂志期刊上。该研究对青稞的西藏地方品种LasaGoumang进行了全基因组转录组测序及图普绘图,获得了尺寸为3.89Gb的基因图谱,总共包含3615一个蛋白质编号遗传基因。

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据报,它是阔别小麦基因组(A,D)、麦籽基因组物理学图、国际性小麦大家族基因组研究工作中的又一个划时代的转型,给未来麦类农作物的改善及其别的高原地区农作物的研究工作中获得了珍贵的参考文献。为表明了青稞的高原地区适应能力体制,了解其发源、饲养及栽培繁育全过程,青海省农牧业研究院、青海省麦籽和野牦牛培养重点实验室、中科院、深圳市深圳华大基因研究院、华大科技等以内的诸多研究企业于二0一二年月起动了青稞基因组研究项目合作。青稞,在西藏语中称之为Ne,在生物学上是一种裸麦籽。和别的麦籽各有不同,青稞历经藏族老百姓长达3500年—4000年的饲养栽培,早就基本上适应能力了极端化的高原山地气候,沦落了藏族老百姓的正餐。

据报,西藏地区的青稞种植总面积占到西藏播种面积的70%。如今,西藏自治区是全球青稞的饲养和多元化品种栽培管理中心之一。新闻记者从深圳华大基因了解,该研究应用仅有基因组鸟枪法转录组测序,对西藏自治区的地区品种青稞LasaGoumang进行了多方位了解。

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据统计,青稞基因组尺寸大概为4.5Gb,此次研究所创设的青稞基因组图普尺寸为3.89Gb,总共占到青稞基因组的87%,包含了3615一个蛋白质编号遗传基因。接着,研究工作人员将青稞基因组和别的的莎草科农作物基因组进行了核查,結果寻找青稞大概于1700万年以前从细山羊草(小麦D)、乌拉尔图小麦(小麦A)及其冬小麦中提取。研究工作人员更进一步剖析寻找,当代青稞基因组中仍然有很多的编码序列同细山羊草(小麦D),乌拉尔图小麦(小麦A)和细柄二叶草相仿,其相仿遗传基因家中数量达到18849个。研究工作人员又更进一步对青稞的高原地区适应能力和人力随意选择状况进行了研究。

根据对10株天然的和栽培青稞品种的轻转录组测序,研究工作人员寻找,天然的青稞品种的SNP数量是栽培青稞的2倍,这表述人力繁育全过程给青稞品种带来了遗传基因短板。


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